Joaquín Giner Lamia
Grupo: Expresión génica y regulación metabólica en cianobacterias
Lab: LS101
Posición: Profesor Contratado Doctor US
Contacto:
Lab: LS101
Despacho: DS107
tel. 954489601 ext. 446003
Email:
Formación
- Investigador Postdoctoral, Comparative Genomics and Metagenomic, Lab 2018-2023, CBGP-UPM. Madrid
- Investigador Postdoctoral, Intracellulars Pathogens Lab, 2017-2018, CNB, Madrid
- Investigador Postdoctoral, SysBioLAb, 2014-2016, Universidad de Algarve. Portugal
- Doctor en Biología Molecular en 2012 (Universidad de Sevilla)
- Licenciado en Biología 2006 (Universidad de Sevilla)
Intereses de Investigación
Actualmente trabajo principalmente dos lineas de investigación: 1) explorar el papel que tienen las vesículas extracelulares bacterianas en la acomodación al estrés ambiental, 2) Caracterizar la diversidad funcional de cianobacterias. Ambas lineas engloban abordajes hibridos de laboratorio y computacionales, analizando datos genómicos, metagenómicos y transcriptomicos. Mi objetivo final es encontrar y caracterizar genes y procesos biológicos que faciliten la adaptación microbiana a diferentes condiciones ambientales.
Publicaciones
| 1.Functional and evolutionary significance of unknown genes from uncultivated taxa. Rodríguez Del Río Á, Giner-Lamia J, Cantalapiedra CP, Botas J, Deng Z, Hernández-Plaza A, Munar-Palmer M, Santamaría-Hernando S, Rodríguez-Herva JJ, Ruscheweyh HJ, Paoli L, Schmidt TSB, Sunagawa S, Bork P, López-Solanilla E, Coelho LP, Huerta-Cepas J. Nature. 2024 Feb;626(7998):377-384. doi: 10.1038/s41586-023-06955-z |
| 2.GeCoViz: genomic context visualisation of prokaryotic genes from a functional and evolutionary perspective. Botas J, Rodríguez Del Río Á, Giner-Lamia J, Huerta-Cepas J. Nucleic Acids Res. 2022 Jul 5;50(W1):W352-W357. doi: 10.1093/nar/gkac367 |
| 3.Extracellular vesicles as an alternative copper-secretion mechanism in bacteria.Lima S, Matinha-Cardoso J, Giner-Lamia J, Couto N, Pacheco CC, Florencio FJ, Wright PC, Tamagnini P, Oliveira P. J Hazard Mater. 2022 Jun 5;431:128594. doi: 10.1016/j.jhazmat.2022.128594 |
| 4.Towards the biogeography of prokaryotic genes. Coelho LP, Alves R, Del Río ÁR, Myers PN, Cantalapiedra CP, Giner-Lamia J, Schmidt TS, Mende DR, Orakov A, Letunic I, Hildebrand F, Van Rossum T, Forslund SK, Khedkar S, Maistrenko OM, Pan S, Jia L, Ferretti P, Sunagawa S, Zhao XM, Nielsen HB, Huerta-Cepas J, Bork P. Nature. 2022 Jan;601(7892):252-256. doi: 10.1038/s41586-021-04233-4 |
| 5.Identification of the direct regulon of NtcA during early acclimation to nitrogen starvation in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.Giner-Lamia J, Robles-Rengel R, Hernández-Prieto MA, Muro-Pastor MI, Florencio FJ, Futschik ME. Nucleic Acids Res. 2017 Nov 16;45(20):11800-11820. doi: 10.1093/nar/gkx860 |